Prezentarea admiralneuro! | R-BLOGGERS

(Acest articol a fost publicat pentru prima dată pe Blog farmaceutși a contribuit cu drag la R-Bloggers). (Puteți raporta problema despre conținutul de pe această pagină aici)

Doriți să vă împărtășiți conținutul pe R-Bloggers? Faceți clic aici dacă aveți un blog sau aici dacă nu.

{admiralneuro} se alătură familiei ca cel mai recent {amiral} Pachet de extensie. Pachetul sprijină zonele de boli neurologice, cu eliberarea inițială a versiunii 0.1.0 concentrându -se pe boala Alzheimer.

Pachetul s -a născut dintr -o colaborare între Eli Lilly, Roche, Cytel, GSK și contribuitori din industria mai largă. Întreținerea pachetului este Jian Wang (Eli Lilly).

În versiunea de 0,1,0, {admiralneuro} oferă următoarele:

• Datele testului SDTM specifice specifice alzheimerului-la acest lucru {PharmaverseSDTM} pentru eliberarea 0.2.0 a {admiralneuro}
  • DM-Set de date demografice, inclusiv pacienții Alzheimer adecvați vârstei
  • NV-Set de date privind examenele neurologice, inclusiv scanările de animale de companie amiloide și tau la început și două vizite de urmărire
  • SuppNV – Set de date privind examenele neurologice suplimentare, inclusiv regiunile de referință utilizate pentru calculele SUVR
  • Ag – Set de date pentru agenți, inclusiv detalii privind tracerea pentru scanările de animale de companie amiloide și tau
• O funcție cu totul nouă admiralneuro :: calcul_centiloid () Acest lucru calculează valorile centiloide pe baza tracerului de animale de companie amiloid, a conductei SUVR și a regiunii de referință
• Două programe de șabloane pentru Adapt și AdTpet
• O creare corespunzătoare ADTPET și VIGNETTE ADAPETĂ

library(admiral)
library(admiralneuro)
library(dplyr)

adapet_example <- admiralneuro::admiralneuro_adapet %>%
  filter(PARAMCD == "SUVRBFBB")

adapet_example <- adapet_example %>%
  admiral::derive_param_computed(
    by_vars = c(
      get_admiral_option("subject_keys"),
      exprs(ADT, ADY, VISIT)
    ),
    parameters = c("SUVRBFBB"),
    set_values_to = exprs(
      AVAL = compute_centiloid(
        tracer = "18F-Florbetaben",
        pipeline = "BERKELEY FBB SUVR PIPELINE",
        ref_region = "Whole Cerebellum",
        suvr = AVAL
      ),
      PARAMCD = "CENTLD",
      PARAM = "Centiloid value derived from SUVR pipeline",
      AVALU = "CL"
    )
  )

use_ad_template("ADTPET", package = "admiralneuro")

use_ad_template("ADAPET", package = "admiralneuro")

Suntem încântați să împărtășim prima versiune a {admiralneuro} Și sperăm că va fi o resursă valoroasă pentru cei care lucrează în spațiul bolii Alzheimer. Așteptăm cu nerăbdare să extindem pachetul în versiunile viitoare pentru a include patologia alfa-sinucleină, un semn distinctiv al bolii Parkinson care se găsește și în alte afecțiuni neurodegenerative, inclusiv în boala Alzheimer. Vom adăuga, de asemenea, funcții pentru a explora deficiența olfactivă, un semnal fascinant timpuriu legat atât de boala Parkinson, cât și de boala Alzheimer.