Cercetătorii de citometrie în flux au la dispoziție o colecție tot mai mare de instrumente R și Bioconductor. Dar pentru cineva care se simte confortabil să lucreze cu date de citometrie și are puțină experiență în programare, poate fi dificil să știe de unde să înceapă. Acesta este golul pe care cursul gratuit Citometria în R își propune să îl umple.
Un punct de plecare pentru cercetătorii în citometrie
Dezvoltat de David Rach și colegii de la Flow Cytometry Shared Resource al University of Maryland Greenebaum Comprehensive Cancer Center, Cytometry in R a început în februarie 2026 ca un curs săptămânal gratuit pentru persoanele cu experiență în citometrie, dar puțin sau deloc fundal de codare.
Răspunsul a fost încurajator. În prezentarea sa BioC2026, David a raportat aproape 2.000 de expresii de interes din întreaga lume și câteva sute de spectatori pentru subiecte săptămânale individuale.
Explorați materialele cursului și programul | Urmăriți înregistrările cursurilor
Ce urmează după cursul introductiv?
La reuniunea Comitetului de formare a bioconductorilor din octombrie 2026, David a descris o oportunitate de a continua cursul. Introduce multe pachete de citometrie, dar rămâne un decalaj între pregătirea introductivă și cunoștințele necesare pentru a lucra prin niște viniete de pachete individuale.
Materiale suplimentare care abordează aceste lacune ar putea ajuta. Autorii pachetelor, utilizatorii experimentați și instructorii pot contribui cu exemple lucrate, studii de caz reproductibile sau tutoriale pas cu pas. Acestea ar putea ajuta cursanții să exploreze pachete dincolo de cele acoperite de curs și să le aplice la propriile lor întrebări de cercetare.
Conectarea participanților la curs și a dezvoltatorilor de pachete
David, care s-a alăturat recent Comitetului consultativ al comunității Bioconductor, coordonează acum noul grup de lucru Bioconductor Cytometry, care își propune să sprijine eforturile comunității în ceea ce privește documentarea și întreținerea pe termen lung a pachetelor pentru citometria convențională, spectrală, imagistică și de masă.
Planul său este să reia legătura cu dezvoltatorii de pachete, să le înțeleagă prioritățile și să identifice unde ar fi binevenite documentație sau asistență suplimentară. O posibilitate este o scriere concentrată sau un sprint de documentare, aducând Citometria interesată în participanții R împreună cu menținătorii de pachete pentru a lucra la sarcini specifice, gestionabile.
Acest lucru ar putea oferi cursanților o cale susținută pentru a contribui: învățarea să utilizeze un pachet, câștigarea încrederii în documentația și exemplele acestuia și contribuția la îmbunătățirea experienței pentru următoarea persoană.
Implică-te
Există mai multe modalități de a contribui, în funcție de experiența și interesele dvs.:
- Dezvoltatorii de pachete ar putea identifica lipsurile de documentare și ar putea sugera sarcini în care contribuția comunității ar fi binevenită.
- Utilizatori și instructori cu experiență ar putea dezvolta tutoriale, exemple sau materiale de legătură pentru cursanții gata să exploreze în continuare.
- Participanții la curs ar putea testa instrucțiunile, să sublinieze pașii confuzi și să ia parte la activități de documentare susținută pe măsură ce acestea se dezvoltă.
Sunteți interesat să vă alăturați sau să urmăriți discuțiile? Alăturați-vă Bioconductorului Zulip și abonați-vă la citometrie canal pentru a te prezenta, a împărtăși idei și a contribui la modelarea primelor activități ale grupului. Utilizatorii, cursanții, instructorii și dezvoltatorii de pachete sunt cu toții bineveniți.
Cursul oferă un punct de plecare accesibil pentru cercetătorii în citometrie noi în R. Grupul de lucru oferă o modalitate de a construi pe baza acelei învățări și de a contribui la instrumentele și resursele pe care se bazează comunitatea.
