Pachete Roche Open-Source TLG Treceți la pharmaverse

De ce trecerea la pharmaverse?

Când am incubat inițial aceste pachete sub insightsengineering, obiectivul nostru principal a fost să modernizăm fluxurile de lucru de raportare clinică și să inițiem explorarea datelor interactive și reproductibile. Cu toate acestea, open source în industria farmaceutică este cel mai puternic atunci când este construit cu comunitatea, nu doar pentru ea.

Mutarea acestor pachete direct sub organizația pharmaverse:

1. Înlătură barierele în calea colaborării: Trecerea dincolo de luarea deciziilor condusă de o singură organizație permite altor companii și colaboratori comunitari să contribuie la modelarea priorităților, a foilor de parcurs și a dezvoltării.
2. Armonizează ecosistemul: Consolidarea instrumentelor standard de manipulare a datelor clinice, creare de tabele și explorare într-o organizație unificată face mai ușor pentru echipele din sponsorii din industrie și CRO să adopte, să contribuie la și să integreze instrumente.
3. Promovează durabilitatea pe termen lung: Acesta deschide calea pentru proprietate comună, co-întreținere de bază și guvernanță mai largă a industriei în stivele de științe a datelor din știința vieții.

Ce pachete au migrat?

Tranziția a avut loc treptat în ultimele câteva luni și include pachete fundamentale care acoperă raportare tabelară, module de analiză clinică și explorare interactivă:

• Fundația de raportare și tabulare:
  • formatatoare — Motor de randare de bază pentru ASCII și layout-uri de tabel cu text îmbogățit.
  • rtables — Rezumate tabelare și generare complexă de layout pe mai multe niveluri.
  • rlistings — Listări clinice care acceptă paginarea și formatarea afișajului.
  • cards & cardx — Crearea de seturi de date privind rezultatele analizei (ARD) și utilitare de ajutor statistic.
• Module de analiză și automatizare:
  • tern — Tabelele, cifrele și listele standard ale studiilor clinice (TLG).
  • autoslider.core — Motoare automate de prezentare/generare de diapozitive.
• Explorare interactivă (ecosistem {teal}):

Ce modificări pentru utilizatori și dezvoltatori?

• Utilizatori CRAN / Eliberare: Zero schimbări de ruptură. Mutarea depozitului nu modifică versiunile de pachete lansate existente. Dacă instalați aceste versiuni prin CRAN sau printr-o oglindă internă, nu sunt necesare modificări ale codului dvs. R ca urmare a mutării.
• Telecomenzi GitHub și versiuni de dezvoltare: GitHub gestionează automat redirecționarea pentru mutarea depozitului, dar vă recomandăm să actualizați telecomenzile de dezvoltare și remotes::install_github() / pak::pkg_install() referințe de la insightsengineering/ la pharmaverse/:

pak::pkg_install("pharmaverse/teal")
pak::pkg_install("pharmaverse/rtables")

• Contribuții și urmărirea problemelor: Pentru pachetele migrate, toate instrumentele de urmărire a problemelor active, solicitările de funcții și discuțiile sunt acum centralizate în pharmaverse/. Sunteți binevenit să trimiteți PR-uri, să sugerați funcții sau să raportați erori direct acolo.

Privind înainte

Pe măsură ce aceste pachete devin parte din pharmaverse, așteptăm cu nerăbdare o participare mai largă și o administrare comună în întreaga comunitate. Salutăm contribuțiile companiilor și persoanelor fizice pentru a le ajuta să le modeleze direcția și să le susțină dezvoltarea continuă.