Un triumf colaborativ: reutilizarea datelor de testare dintre NEST și echipele amirale

URMĂREȘTE-NE
16,065FaniÎmi place
1,142CititoriConectați-vă

(Acest articol a fost publicat pentru prima dată pe blogul pharmaverseși cu amabilitate a contribuit la R-bloggeri). (Puteți raporta problema legată de conținutul acestei pagini aici)


Doriți să vă distribuiți conținutul pe R-bloggeri? dați clic aici dacă aveți un blog, sau aici dacă nu aveți.


Introducere

În lumea dinamică a cercetării clinice, inovația și colaborarea sunt factori cheie ai succesului. NEST și {amiral} echipele exemplifică acest lucru prin pachetele lor inovatoare. Prin folosirea instrumentelor open-source și prin promovarea unei abordări bazate pe comunitate, aceștia au integrarea datelor și metodologiile de raportare semnificativ avansate în cadrul cercetării clinice. Această poveste celebrează una dintre primele ocazii în care NEST și {amiral} au putut să-și unească forțele și să colaboreze.

Cine sunt echipa NEST?

Echipa NEST, un acronim pentru Instrumente exploratorii și standardizate de generație următoare, a lansat o colecție de pachete R cu sursă deschisă concepute pentru a accelera generarea de informații în contextul cercetării clinice. Originar la Roche, NEST a atras o gamă diversă de colaboratori din mediul academic, industria farmaceutică și institute de cercetare clinică, în mare parte datorită eforturilor precum pharmaverse. Misiunea lor este de a accelera raportarea clinică și de a primi contribuții din partea comunității științifice mai largi.

Cine sunt echipa amiral?

Concentrat pe un scop complementar, cel {amiral} Echipa este dedicată furnizării unui set de instrumente modular, open-source pentru crearea de seturi de date ADaM în R. Abordarea lor este transparentă și colaborativă, dând putere utilizatorilor să creeze și să perfecționeze o metodologie armonizată pentru dezvoltarea ADaM în industria farmaceutică. The {amiral} echipa își proiectează instrumentele astfel încât să fie ușor de utilizat și versatile, capabile să răspundă unei game largi de cerințe de date.

Pregătirea scenei pentru colaborare

În urmă cu peste un an, a fost identificată o oportunitate de colaborare în cadrul NEST și {amiral} . Într-adevăr, echipa NEST s-a bazat pe date simulate pentru testarea integrării și alimentarea Catalogului său TLG, care adesea nu a avut realism și nu a reușit să acopere cazurile marginale sau să expună limitările software. Prin conversații în cadrul pharmaverse, sa realizat că unele dintre aceste provocări ar putea fi abordate prin trecerea la utilizarea datelor de testare mai realiste oferite de {pharmaverseadam} pachet (întreținut de {amiral} echipă). Sursa datelor din interior {pharmaverseadam} este datele reale SDTM publicate prin intermediul pilotului CDISC Test Data, convertite în ADaM prin rularea programului {amiral} programe șablon pe el.

Acest potențial pivot ar fi benefic pentru ambele echipe. În primul rând, ar permite echipei NEST să realizeze teste mai realiste și mai cuprinzătoare, sporind astfel robustețea activității lor de dezvoltare. Simultan, ar însemna că {amiral} echipa va primi feedback de la NEST despre robustețea ambelor {pharmaverseadam} seturile de date și șabloanele folosite pentru a le genera.

Realizări cheie

Lunile următoare au fost o perioadă de colaborare pentru cele două echipe, deoarece această schimbare a fost pusă în aplicare. Au fost identificate numeroase realizări:

  • Integrare realistă a datelor: Trecerea de la date simulate la date mai realiste a oferit echipei NEST condiții de testare mai precise și mai relevante. Această schimbare a fost crucială în identificarea și rectificarea potențialelor limitări ale software-ului.

  • Managementul domeniului de aplicare și al dependenței: Ambele echipe au convenit să evite crearea de interdependențe puternice care ar putea extinde ciclurile de lansare. Pachetele NEST au păstrat date minime în scopuri de documentare, în timp ce {amiral} a păstrat separat seturi extinse de date.

  • Integrare și automatizare CI: În ceea ce privește NEST, noile teste de integrare CI au asigurat că actualizările șablonului au fost verificate automat în raport cu stocarea {pharmaverseadam} seturi de date. Acest lucru a menținut consecvența și a permis dezvoltatorilor să identifice rapid schimbările intenționate.

  • Conducte strategice: A fost înființată o conductă în {pharmaverseadam} astfel încât orice actualizări ale {pharmaversesdtm} seturi de date sursă și/sau {amiral} Scripturile șablon pot declanșa o actualizare a {pharmaverseadam} .

Evoluții recente

Colaborarea a dat roade, deoarece echipele au descoperit perspective și îmbunătățiri esențiale. De exemplu, folosind {pharmaverseadam} date în {scda.test} pachetul a ajutat echipa NEST să identifice și să corecteze problemele în dezvoltarea șablonului de tabel, în special în calcularea valorilor numitorului. Datele realiste de testare au relevat, de asemenea, inconsecvențe minore în derivarea datelor ECG în cadrul {amiral} șabloane, care au fost abordate cu promptitudine, îmbunătățind calitatea datelor.

Concluzie

Colaborarea dintre NEST și {amiral} echipele prezintă puterea inițiativelor open-source și a eforturilor conduse de comunitate, cum ar fi pharmaverse, în promovarea cercetării clinice. Prin integrarea datelor realiste și rafinarea proceselor lor de testare, aceștia au îmbunătățit semnificativ robustețea și fiabilitatea instrumentelor lor. Acest parteneriat nu numai că accelerează generarea de informații, ci și cultivă o cultură a colaborării și a inovației, de care beneficiază comunitatea mai largă din domeniul farmaceutic.

Succesul acestei colaborări evidențiază impactul profund al obiectivelor comune și al inovației colective, deschizând calea pentru progresele viitoare în metodologiile și rezultatele cercetării clinice.

Mulțumiri

Dorim să mulțumim următoarelor persoane pentru sprijinul acordat în cadrul acestui proiect:

  • Daphne Grasselly pentru stabilirea conductei automate de reîmprospătare CI în {pharmaverseadam} și Kangjie Zhang pentru conducerea {pharmaverseadam} echipa în 2024.

  • Ben Straub, Stefan Bundfuss, Zelos Zhu, Ross Farrugia și Jeff Dickinson pentru sprijinul acordat {amiral} lateral.

  • Leena Khatri și Emily de la Rua pentru sprijinul din partea NEST.


Ultima actualizare

2025-01-21 14:39:49.444538

Detalii

Reutilizați

Citare

citat BibTeX:

@online{zhu2025,
  author = {Zhu, Joe and Mancini, Edoardo},
  title = {A Collaborative Triumph: {Re-using} Test Data Between the
    {NEST} and Admiral Teams},
  date = {2025-01-15},
  url = {https://pharmaverse.github.io/blog/posts/2025-01-15_nest_and_pharmaverseadam/nest_and_pharmaverseadam.html},
  langid = {en}
}

Pentru atribuire, vă rugăm să citați această lucrare ca:

Zhu, Joe și Edoardo Mancini. 2025. „Un triumf colaborativ: reutilizarea datelor de testare între echipele NEST și Admiral.” 15 ianuarie 2025. https://pharmaverse.github.io/blog/posts/2025-01-15_nest_and_pharmaverseadam/nest_and_pharmaverseadam.html.

Dominic Botezariu
Dominic Botezariuhttps://www.noobz.ro/
Creator de site și redactor-șef.

Cele mai noi știri

Pe același subiect

LĂSAȚI UN MESAJ

Vă rugăm să introduceți comentariul dvs.!
Introduceți aici numele dvs.