Colectarea tuturor datelor! | R-BLOGGERS

URMĂREȘTE-NE
16,065FaniÎmi place
1,142CititoriConectați-vă

(Acest articol a fost publicat pentru prima dată pe Blog farmaceutși a contribuit cu drag la R-Bloggers). (Puteți raporta problema despre conținutul de pe această pagină aici)


Doriți să vă împărtășiți conținutul pe R-Bloggers? Faceți clic aici dacă aveți un blog sau aici dacă nu.


Scopul acestui blog este de a menține o listă continuă de pachete de date disponibile public, date în pachete sau surse de date care se aliniază standardelor CDISC. Speranța mea este că aceasta ar putea fi o resursă pentru:

  • Acei indivizi intruși care doresc să prezinte noi documentații, funcții, pachete și alte instrumente
  • Acei persoane întreprinzătoare care doresc să afle mai multe despre standardele CDISC și explorează instrumente open-source.

Datele prezentate mai jos sunt doar un început și sunt prezentate în ordinea modului în care le -am găsit. Simțiți -vă liber să luați legătura cu mine pentru completări sau clarificări. Mă puteți găsi pe Pharmaverse Slack, alăturându -mă aici. De fapt, încurajez, nu vă implorează, să luați legătura, deoarece acestea nu pot fi toate datele pe care le avem la dispoziție pentru noi!

PharmaverseSDTM: date de testare SDTM pentru familia farmaceutică a pachetelor

Un set de seturi de date de model de tabelare a datelor de studiu (SDTM) din proiectul pilot al Standardelor de schimb de date clinice (CDISC) Proiect pilot utilizat pentru testarea și dezvoltarea seturilor de date Model de date de analiză (ADAM) din cadrul familiei farmaceutice de pachete. Un pilot CDISC a fost realizat undeva între 2008 și 2010. Acestea sunt acele date pilot, dar au fost aduse încet la standardele actuale CDISC. Există, de asemenea, seturi de date noi în același stil (la fel STUDYID, USUBJIDs, etc.) adăugat de {amiral} și {amiral} Echipe de pachete de extensie care furnizează date de testare pentru domenii noi sau TA -uri specifice (oftalmologie, vaccinuri etc.).

Cele mai frecvente seturi de date SDTM pot fi găsite, precum și unele SDTM -uri specifice ale zonei pentru boli care nu sunt disponibile în seturile de date pilot CDIC.

Pharmaversadam: date de testare Adam pentru familia farmaceutică a pachetelor

Un set de seturi de date despre modelul de date de analiză (ADAM) construite folosind seturi de date ale modelului de tabelare a datelor de studiu (SDTM) conținute în {PharmaverseSDTM} pachet și scripturi de șablon din {amiral} familie de pachete.

Amiral: Adam în biblioteca R Asset

O cutie de instrumente pentru programarea Standardelor de schimb de date clinice Consortium (CDISC) Seturile de date privind datele de analiză conforme (ADAM) din seturile de date R. ADAM sunt o parte obligatorie a oricărei noi cereri de licență de medicamente sau biologice transmise la Administrația pentru Alimente și Droguri din Statele Unite (FDA). Derivările de analiză sunt implementate în conformitate cu „Ghidul de implementare a modelului de date de analiză.

Seturi de date limitate ADSL, ADLB sunt prevăzute în {amiral} deoarece scripturile de șablon disponibile în acest pachet sunt utilizate pentru a crea ADAMS în {Pharmaversadam} .

Random.cdisc.Data: Creați seturi de date ADAM aleatorii

Un set de funcții de creat aleatoriu Seturi de date Model de date (ADAM) și seturi de date în cache. Puteți găsi o listă a posibilelor seturi de date CDISC aleatorii generate aici. Specificațiile setului de date ADAM sunt descrise de echipa modelului de date de analiză a datelor de schimb de date clinice (CDISC). Aceste seturi de date sunt utilizate pentru a alimenta catalogul TLG, deși echipa cuibului le înlocuiește activ pentru {Pharmaversadam} Seturi de date în schimb – Vedeți o postare recentă pe blog despre acest efort!

SafetyData: date de studiu clinic

Pachetul din nou formatele seturilor de date Adam și SDTM ale Phuse ca un pachet R în urma celor mai bune practici de date.

Phuse a lansat datele sub licența MIT permisivă, astfel încât reutilizarea cu atribuirea este încurajată. Datele sunt utile în special pentru prototiparea noilor tabele, înregistrări și cifre și pentru scrierea testelor automate.

Documentația de bază pentru fiecare fișier de date este furnizată în fișiere de ajutor (de exemplu, ADAM_ADAE). Specificațiile complete de date sub forma fișierelor define.xml pot fi, de asemenea, găsite la legăturile de mai sus (PDF pentru ADAM și PDF pentru SDTM).

Cuib: accelerarea raportării clinice

Nest este o colecție de pachete R-sursă deschise, care permite generarea de informații mai rapide și mai eficiente în cadrul setărilor de cercetare clinică, atât în ​​scopuri exploratorii, cât și de reglementare.

Au o multitudine de date generate pentru documentare, demonstrații și testări. Puteți găsi toate seturile de date și ce pachete trăiesc aici.

Colectați toate datele!

După cum vedeți, lista este scurtă! Anunță -mă dacă ai surse (mari și mici) și putem adăuga la această listă.


Ultima actualizare

2025-02-17 17: 27: 35.060369

Detalii

Reutilizați

Citare

Dominic Botezariu
Dominic Botezariuhttps://www.noobz.ro/
Creator de site și redactor-șef.

Cele mai noi știri

Pe același subiect

LĂSAȚI UN MESAJ

Vă rugăm să introduceți comentariul dvs.!
Introduceți aici numele dvs.