Ropensci News Digest, aprilie 2025

URMĂREȘTE-NE
16,065FaniÎmi place
1,142CititoriConectați-vă


Dragi prieteni Ropensci, este timpul pentru rotunjirea noastră lunară de știri! Puteți citi această postare pe blogul nostru. Acum să ne aruncăm în activitate la Ropensci și în jurul său!

HQ Ropensci

Eveniment: Căi de carieră pentru oamenii de știință federali din SUA

Ropensci și OpenScapes au norocul să aibă ca membri mulți angajați federali din SUA care ne îmbogățesc munca și comunitatea. Într -o perioadă de mare incertitudine pentru atâția lucrători guvernamentali, dorim să sprijinim membrii noștri care au în vedere următorii pași de carieră.

Alăturați -ne marți, 6 mai, la 20:30 EDT pentru un eveniment de discuție și rețea pentru și cu actualii și foștii oameni de știință ai datelor federale ale guvernului federal.

Mai multe informații.

Programul Ropensci Champions 2025 în spaniolă: Aplicați înainte de 30 aprilie!

Memento: Apelul pentru ca cererile să facă parte din noua cohortă a programului nostru 2025 este deschis până pe 30 aprilie! Pentru prima dată va fi în spaniolă.

Aflați mai multe în apelul nostru pentru aplicații. Va fi deschis până când Miercuri, 30 aprilie 2025.

ropensci în știri

Managerul nostru comunitar, Yanina Bellini Saibene, a fost, de asemenea, intervievat în Naturăpentru articolul „Ce limbaj de programare ar trebui să folosesc? Un ghid pentru cercetătorii de carieră timpurie”

„Comunitatea de utilizatori este, de asemenea, o considerație esențială – Saibene spune că acesta este unul dintre lucrurile pe care le iubește cel mai mult despre comunitatea de utilizatori mare, primitoare și angajată a limbii înseamnă că instrumentele sunt dezvoltate și actualizate frecvent; că grupurile de utilizatori locali există în întreaga lume; și că tutorialele și alte resurse sunt disponibile în multe limbi vorbite, inclusiv în spaniola ei natală.”

Directorul nostru executiv Noam Ross a fost intervievat pentru Natură Articolul „Rămâi în siguranță de ura online cu aceste cinci sfaturi”. Pentru mai multe despre acest subiect, vă recomandăm această lucrare din 2021 de Danielle Smalls și Greg Wilson: „Zece sfaturi rapide pentru a rămâne în siguranță online”.

Mai multe limbi, mai mult acces: Descoperiți Ropensci în spaniolă

Suntem încântați să împărtășim faptul că site -ul nostru web are mai mult conținut decât oricând disponibil în spaniolă! Am început cu Ghidul nostru Dev și unele dintre postările noastre de pe blog. Acum veți găsi, de asemenea, pagini cheie, informații despre proiecte și programe, documentație și resurse comunitare în spaniolă. Această etapă reflectă angajamentul nostru continuu de a face știința deschisă mai incluzivă și mai accesibilă comunităților de limbă spaniolă din întreaga lume. Suntem recunoscători tuturor membrilor comunității care contribuie la eforturile noastre de traducere și localizare.

Coworking

Citiți totul despre coworking!

Și amintiți -vă, puteți oricând să cowork în mod independent la munca legată de R, să lucrați la pachete care tind să fie neglijate sau să lucrați la ceea ce trebuie să faceți vreodată!

Software 📦

Pachete noi

Următoarele două pachete au devenit recent o parte a suitei noastre de software:

  • GTEXR, dezvoltat de Alasdair Warwick împreună cu Benjamin Zuckerman, Abraham Olvera-Barrios, Chuin Ying Ung și Robert Luben: o interfață R convenabilă pentru API-ul portalului de expresie de țesut genotip (GTEX). Proiectul GTEX este o resursă publică cuprinzătoare pentru studierea expresiei și reglării genelor specifice țesuturilor în țesuturile umane. Prin analiza sistematică a datelor de secvențiere ARN de la 54 de site-uri de țesut ne-de la aproape 1000 de indivizi, GTEX oferă informații cruciale asupra relației dintre variația genetică și expresia genelor. Aceste date sunt accesibile prin API -ul portalului GTEX care permite accesul programatic la datele de expresie a genelor umane. Pentru mai multe informații despre API, consultați https://gtexportal.org/api/v2/redoc. Este disponibil pe CRAN. A fost revizuit de Zhian N. Kamvar și Ernest Guevarra.

  • C3DR, dezvoltat de Simon Nolte: Un înveliș pentru biblioteca „EZC3D” pentru a lucra cu datele de captare a mișcării C3D. A fost revizuit de Aymeric Stamm și iulie Pilowsky.

Descoperiți mai multe pachete, citiți mai multe despre revizuirea colegilor de software.

Versiuni noi

Următoarele șaisprezece pachete au avut o actualizare de la ultimul buletin informativ: Butterfly (1.1.2), C3DR (v0.1.1), FedData (v4.3.0), git2r (v0.36.2), gtexr (v0.2.0), ijtiff (v3.1.3), nodbi (v0.12.0), osmapir (v0.2.3), osmexract (v0.5.3), Pangoling (v1.0.3), rb3 (v0.0.12), stPlanr (overlapping_segments_in_overline), Tarchetipuri (0.13.0), ținte (1.11.2), waywiser (v0.6.3), și Weatheroz (v2.0.1)

Recenzie de la egal la egal

Există douăsprezece trimiteri recent închise și active și 5 trimiteri în așteptare. Problemele sunt în diferite etape:

Aflați mai multe despre revizuirea colegilor de software și cum să vă implicați.

Pe blog

Revizuire software

logo -ul Ednajoint.

Solicită contribuții

Apeluri pentru întreținători

Dacă sunteți interesat să mențineți vreunul dintre pachetele R de mai jos, vă puteți bucura să citiți postarea noastră pe blog Ce înseamnă să mențineți un pachet?.

Solicită contribuții

Consultați pagina noastră de ajutor dorită – Înainte de a deschide un PR, vă recomandăm să întrebați dacă este încă nevoie de ajutor.

Colț de dezvoltare a pachetelor

Câteva sfaturi utile pentru dezvoltatorii de pachete R. 👀

Unsprezece sfaturi rapide pentru scrierea unui pachet bioconductor

Dacă intenționați să vă publicați pachetul cu Bioconductor, nu ratați această lucrare de Charlotte Soneson și colaboratori.

Aruncați toate informațiile despre pachete într -un singur fișier pentru LLMS

Cu pachetul RDocdump de Egor Kotov, puteți genera un singur fișier care conține codul sursă, documentația și vinietele unui pachet R. Puteți utiliza apoi fișierul pentru ingestie într -un model de limbaj mare (LLM).

instalator2

Dacă utilizați pachetul de instalații pentru a publica codul dvs. ca API, veți fi interesat de succesorul său, Plumber2 de Thomas Lin Pedersen.

Folosiți o structură de folder cuibărită pentru pachetul dvs.

Dacă visezi să folosești foldere cuibărite pentru stocarea codului R al unui pachet, încercați pachetul DIR experimental de Antoine Fabri.

Ghicirea tipului minim

Știați despre Minty, un pachet R de Chung-Hong Chan care împărtășește instrumentele de tip Inferencing și Parsing utilizate de pachetul original Readr înainte de 2021? Poate fi la îndemână pentru nevoile dvs. de analiză.

Vizualizarea evaluărilor de risc al pachetului R folosind litmus

Un post și un tablou de bord interesant de Pedro Silva, Astrid Radermacher și Colin Gillespie pentru a evalua riscul de pachete.

CI: fixați versiunea R dacă utilizați RENV

Un sfat bun de Christophe Dervieux în spațiul nostru de lucru Slack: dacă utilizați RENV pentru a îngheța dependențele în integrare continuă, ar trebui să fixați versiunea R la ceea ce a fost folosit pentru a construi filetul de blocare al RENV. Acest lucru vă permite să actualizați (și să verificați) totul simultan: versiunile R și versiunile de pachete.

Ultimele cuvinte

Mulțumesc pentru lectură! Dacă doriți să vă implicați cu Ropensci, consultați ghidul nostru care contribuie care vă poate ajuta să vă direcționați către locul potrivit, indiferent dacă doriți să contribuiți la cod, contribuții non-cod sau să contribuiți în alte moduri, cum ar fi partajarea cazurilor de utilizare. De asemenea, puteți susține munca noastră prin donații.

Dacă încă nu v -ați abonat la newsletter -ul nostru, puteți face acest lucru printr -un formular. Până când este timpul pentru următorul nostru buletin informativ, puteți ține legătura cu noi prin intermediul site -ului nostru web și al contului Mastodon.

Dominic Botezariu
Dominic Botezariuhttps://www.noobz.ro/
Creator de site și redactor-șef.

Cele mai noi știri

Pe același subiect

LĂSAȚI UN MESAJ

Vă rugăm să introduceți comentariul dvs.!
Introduceți aici numele dvs.