Hold On Hope: timpii de întârziere de publicare la reviste de biologie celulară

Am postat anterior despre timpii de întârziere de publicare. „Lag” se referă la timpul de la trimiterea unei lucrări și apariția acesteia într-un jurnal.

Perioadele de întârziere de publicare sunt încă o frustrare pentru cercetători. Deși preprinturile eludează întârzierea împărtășirii științei cu alții, publicarea este încă rege când vine vorba de evaluare. Contractele sunt scurte, iar întârzierile de publicare pot fi lungi…

Am văzut recent o postare care compară timpii medii de întârziere de publicare pentru reviste de genetică. Acest lucru m-a motivat să-mi actualizez codul și să reluez analiza pentru reviste de biologie celulară pentru a vedea ce s-a schimbat, dacă este ceva.

Metodologie

Am scris un pachet R PubMedLagR care folosește {rentrez} pentru a prelua datele publicației din PubMed. Odată ce avem aceste date, este vorba de a produce unele parcele pe care le-am tratat anterior. Pentru a ne asigura că ne uităm doar la lucrări de cercetare, folosim "journal article"(pt) ca termen de căutare și, de asemenea, eliminați din date orice altceva (Recenzii, Comentarii etc.). Simțiți-vă liber să-l folosiți pentru a consulta alte reviste.

Avertismente

Înainte de a începe, există câteva avertismente. Analiza este la fel de bună ca și datele PubMed. Nu toate revistele își trimit informațiile despre data către PubMed, în timp ce pentru altele sunt incomplete (așa cum vom vedea mai jos). Cu siguranță există inexactități. Am găsit o lucrare care se presupune că a fost depusă pe 1970-01-01, cu mai bine de 40 de ani înainte de a începe jurnalul. De asemenea, este bine cunoscut faptul că unele reviste „repornesc ceasul” pe o hârtie respingând-o și permițând retrimiterea, apoi numărând doar versiunea retrimisă. Deci, comparația între reviste este puțin complicată, dar ne permite să privim tendințele.

Să ne scufundăm

Putem folosi următorul cod pentru a prelua datele care ne interesează.

library(PubMedLagR)
jrnl_list <- c("J Cell Sci", "Mol Biol Cell", "J Cell Biol", "Nat Cell Biol",
               "EMBO J", "Biochem J", "Dev Cell", "FASEB J", "J Biol Chem",
               "Cells", "Front Cell Dev Biol", "Nature Communications",
               "Cell Reports", "Mol Cell", "Autophagy", "Cell Death Differ",
               "Cell Death Dis", "Cell Res", "Sci Adv", "Cell")
yrs <- 2006:2026
retrieve_journal_year_records(jrnl_list, yrs, batch_size = 250)
pprs <- pubmed_xmls_to_df()

Lista revistelor este oarecum arbitrară. Am inclus Nature Communications și Science Advances, deși au multe alte lucrări în afară de biologia celulară. Am inclus Cell (chiar dacă nu există prea multă biologie celulară acolo în zilele noastre) și am omis Natura și Știința.

Câte lucrări sunt în fiecare dintre aceste reviste și cum s-a schimbat asta de-a lungul timpului?

Există o creștere uriașă a numărului de lucrări publicate de Nature Communications, Science Advances și Cell Reports. Nature Communications este un uriaș, publicând aproximativ 12.500 de lucrări în 2025.

A existat un boom și o criză în publicațiile de la Front Cell Dev Biol și Cells, care s-ar putea datora unor probleme de reputație (cum ar fi aceasta). Alte reviste au scăzut. Cel mai vizibil J Biol Chem, dar alții au primit o lovitură. Motivele din spatele acestor dinamici sunt discutate în altă parte.

Timpul mediu de întârziere de publicare

Vom folosi de la primit până la publicare ca măsură a timpului de întârziere de publicare. Acesta este timpul de la depunere până la apariția acestuia în jurnal „în tipărire”. Aici se măsoară în zile.

În ultimii 5 ani, timpul mediu de întârziere la Nature Cell Biology este de peste un an. Alte puncte de vânzare sunt aproape de aceasta, de exemplu Cell, Dev Cell; în timp ce altele persistă în jur de 200 de zile sau mai puțin în cazul J Cell Sci, FASEB J și colab. Jurnalul Autophagy lipsește aici deoarece nu există date pentru el. Alții, precum Sci Adv, MBoC au doar date minime disponibile. Cei mai scurti timpi de întârziere au fost pentru Cells (ceea ce ar putea să nu surprindă pe unii oameni).

Partea leului din acest timp de întârziere este timpul de la depunere până la acceptare (primit-acceptat), cu o mică contribuție din timpul necesar publicării oficiale a articolului (acceptat-publicat).

Aceasta este folosirea timpului mediu. Evident, unele hârtii intră direct, în timp ce altele… nu. Să aruncăm o privire.

Puteți vedea multe exemple de lucrări care au timpi de întârziere de 1, 2 sau 3 ani. Am scalat toate parcelele la un timp de întârziere maxim de 3 ani. Au existat mai multe exemple de lucrări cu timpi de întârziere de până la 7 ani care păreau a fi autentice, dar au distorsionat viziunea.

Deci, ce tendințe putem vedea?

Timpurile de întârziere cresc la unele reviste, dar nu la altele. Este posibil să vedeți niște perioade de întârziere foarte scurte (între cele mai lungi) recent la Dev Cell, Mol Cell și EMBO J. Presupun că acestea sunt transferuri în jurnal, care duc la publicare rapidă. Deși Cell are și multe dintre acestea, deci poate că există și alte explicații.

Pentru a face clic, totuși, mai detaliat, am realizat câteva grafice pentru fiecare jurnal, care folosesc linii de creastă pentru a vedea profilul timpilor de întârziere pentru fiecare an.

Și în sfârșit

De altfel, nouă dintre primele zece lucrări cu cele mai lungi timpi de întârziere au fost publicate în Nature Communications. Cel mai lung a fost acesta (3263 zile). Aproape nouă ani! Toate ziarele au poveștile lor de luptă și sunt sigur că acesta are o poveste de spus.

—

Titlul postării provine din „Hold On Hope” de la Guided by Voices.