Aplicații de analiză bioinformatică freeCount pe Posit Cloud

URMĂREȘTE-NE
16,065FaniÎmi place
1,142CititoriConectați-vă

(Acest articol a fost publicat pentru prima dată pe R – Myscapeși cu amabilitate a contribuit la R-bloggeri). (Puteți raporta problema legată de conținutul acestei pagini aici)


Doriți să vă distribuiți conținutul pe R-bloggeri? dați clic aici dacă aveți un blog, sau aici dacă nu aveți.

Prezentare generală

O modalitate prin care puteți utiliza aplicațiile (aplicațiile) freeCount R Shiny online este prin Posit Cloud, care vă permite să accesați instrumente puternice de știință a datelor în browser fără a fi nevoie de instalare sau configurație complexă.

freeCount

Cadrul de analiză freeCount oferă un set modular de instrumente și tutoriale pentru o abordare structurată a analizei datelor de numărare biologică. Utilizatorii sunt ghidați prin abordări comune de evaluare, procesare și analiză a datelor.

Diferitele instrumente de analiză disponibile în prezent includ:

  • Analiza expresiei diferențiale (DE) – DA
  • Analiza rețelei – N / A
  • Analiza functionala – FA
  • Setați operațiuni – AŞA

Posit Cloud

Posit Cloud vă permite să faceți, să partajați, să predați și să învățați știința datelor folosind RStudio sau Jupyter Notebooks direct din browser. Posit Cloud oferă un spațiu de lucru personal care vă permite să lucrați la propriul conținut și puteți lăsa conținutul să fie vizualizat de alții.

Pași

Următorii pași vă vor ghida prin cum să rulați online aplicațiile freeCount folosind Posit Cloud.

  1. Navigați la https://posit.cloud/ și conectați-vă (creați un cont, dacă este necesar)
  2. În spațiul dvs. de lucru, faceți clic pe „Proiect nou” și selectați „Proiect nou din depozitul Git”
  3. În fereastra pop-up Proiect nou din depozitul Git, introduceți următoarele în caseta de text URL și faceți clic pe „OK”: https://github.com/ElizabethBrooks/freeCount

    Așteaptă pentru ca proiectul să fie implementat în spațiul de lucru Posit Cloud

  4. Navigați la directorul „aplicații” din panoul de fișiere (fereastra din dreapta jos)
  5. Apoi, navigați la directorul „cloud” din panoul de fișiere
  6. Selectați aplicația pe care doriți să o rulați din lista de fișiere R shiny app
  7. Faceți clic pe butonul „Run App” din colțul din dreapta sus al panoului sursă
  8. Faceți clic pe „Da” în fereastra pop-up Instalare pachet Shiny

    Așteaptă pentru ca pachetele R necesare să se instaleze în spațiul de lucru Posit Cloud

    Făcut! În cele din urmă, aplicația strălucitoare ar trebui să se lanseze și să vă permită să rulați analiza selectată


Pasul 1

Navigați la https://posit.cloud/ și conectați-vă (creați un cont, dacă este necesar).

Pasul 2

În spațiul dvs. de lucru, faceți clic pe „Proiect nou” și selectați „Proiect nou din depozitul Git”.

Pasul 3

În fereastra pop-up Proiect nou din depozitul Git, introduceți următoarele în caseta de text URL și faceți clic pe „OK”: https://github.com/ElizabethBrooks/freeCount

Așteaptă…

Așteptați ca proiectul să fie implementat în spațiul dvs. de lucru Posit Cloud.

Pasul 4

Navigați la directorul „aplicații” din panoul de fișiere (fereastra din dreapta jos).

Pasul 5

Apoi, navigați la directorul „cloud” din panoul de fișiere.

Pasul 6

Selectați aplicația pe care doriți să o rulați din lista de fișiere R shiny app.

Pasul 7

Faceți clic pe butonul „Run App” din colțul din dreapta sus al panoului sursă.

Pasul 8

Faceți clic pe „Da” în fereastra pop-up Instalare pachet Shiny.

Așteaptă…

Așteptați ca pachetele R necesare să se instaleze în spațiul de lucru Posit Cloud.

Făcut!

În cele din urmă, aplicația strălucitoare ar trebui să se lanseze și să vă permită să rulați analiza selectată.


Depanare

Sesiunea Posit Cloud R a fost deconectată – Dacă utilizați Google Chrome, încercați să dezactivați funcția de eliminare a filelor din Chrome. Chrome descarcă automat filele de fundal pentru a economisi memorie.


Notă importantă

Rețineți că nu toate aplicațiile sau funcțiile sunt disponibile pentru versiunea cloud a aplicațiilor freeCount din cauza limitelor planului gratuit pentru Posit Cloud.

Dominic Botezariu
Dominic Botezariuhttps://www.noobz.ro/
Creator de site și redactor-șef.

Cele mai noi știri

Pe același subiect

LĂSAȚI UN MESAJ

Vă rugăm să introduceți comentariul dvs.!
Introduceți aici numele dvs.