Conferința North American Bioconductor 2026 (((BioC2026))(https://bioc2026.bioconductor.org/)) a avut loc în perioada 10-12 august 2026, la Fred Hutchinson Cancer Center din Seattle, Washington. Conferința a reunit cercetători, dezvoltatori, educatori și membri ai comunității pentru a explora evoluțiile actuale din cadrul și dincolo de proiectul Bioconductor. BioC2026 a primit 108 participanți, dintre care 70 au participat personal și 38 s-au alăturat virtual. Pe parcursul celor trei zile, programul a inclus trei vorbitori principali, 20 de vorbitori contributivi și 17 sesiuni. Programul a evidențiat amploarea cercetării biologice susținute de Bioconductor, precum și instrumentele, infrastructura și comunitățile care permit biologia computațională deschisă și reproductibilă. Conferința a fost apoi urmată de două evenimente comunitare în perioada 13-14 august: un workshop Carpentries privind orchestrarea analizei la scară largă a celulelor unice cu Bioconductor și Hackathonul Bioconductor North America 2026.
Participanți pe țară
Participanții au călătorit la Seattle din toată America de Nord și nu numai, reflectând acoperirea internațională a comunității Bioconductor. Participanții s-au alăturat din Statele Unite, Canada, Germania, Irlanda, Regatul Unit, Australia și Nigeria. Publicul a inclus cercetători aflati în diferite etape ale carierei lor, personalul reprezentând 42% dintre participanți, urmat de studenți și cercetători postdoctorali cu 28%, facultate cu 13,8%, industria cu 13,8% și guvern cu 2,4%.
Prezentare generală a programului
Notele cheie
Conferința a prezentat trei vorbitori principali: – Jeff Leek a vorbit despre „Clădirea unei infrastructuri deschise pentru IA translațională într-un centru de cancer” – Ting Ye a vorbit despre „De la asociere la cauzație: Inferență cauzală legată de genetică în biologia umană” – Michael Lawrence a vorbit despre „S7 pentru bioconductor”
(De la stânga la dreapta: Jeff Leek, Michael Lawrence și Ting Ye își susțin discursurile la BioC2026)
Discuții scurte
Douăzeci de vorbitori contribuiți și-au împărtășit munca pe parcursul programului conferinței. Scurtele discuții de la BioC2026 au reflectat amploarea cercetării și dezvoltării în comunitatea Bioconductor. Subiectele au variat de la formarea comunității și implicarea dezvoltatorilor până la explorarea multi-omică, fluxuri de lucru reproductibile și infrastructură AI. Programul a acoperit, de asemenea, domenii emergente ale analizei datelor biologice, inclusiv transcriptomica spațială, analiza repertoriului de anticorpi, testarea variantelor rare, metilarea ADN-ului, variația structurală și Perturb-seq.
Sesiuni de poster și sesiuni demonstrative de pachete
Sesiunea de poster a prezentat o gamă variată de aplicații de cercetare și proiecte de dezvoltare software din întreaga comunitate Bioconductor. Subiectele au inclus transcriptomica unicelulară și spațială, integrarea multi-omică, analiza microbiomului, proteomica, analiza repertoriului de anticorpi, îmbogățirea funcțională, inferența strămoșilor, procesarea datelor genomice și descoperirea de medicamente ghidată de AI. Posterele au oferit participanților o oportunitate de a discuta despre noi metode și instrumente într-un cadru mai informal, conectând în același timp cercetătorii, dezvoltatorii de pachete și membrii comunității care lucrează în diferite domenii ale biologiei computaționale. Sesiunile au completat, de asemenea, demonstrațiile pachetului, creând spațiu pentru participanți să exploreze software-ul nou și să se angajeze direct cu oamenii care dezvoltă și aplică instrumente Bioconductor.
Feedback-ul de la conferință a arătat că aceste interacțiuni au fost deosebit de valoroase, participanții evidențiind conversațiile despre postere și demonstrații de pachete ca unele dintre cele mai utile oportunități de creare de rețele.
Participanții în timpul sesiunii de poster.
Sărbătorim 25 de ani de Bioconductor
Sărbătorile care marchează cea de-a 25-a aniversare a Bioconductor au continuat la BioC2026, după sărbătorile care au început la EuroBioC2026 la începutul anului. Piatra de hotar a fost marcată cu un tort aniversar cu o marcă specială, mulțumind participanților și membrilor comunității pentru că au făcut parte din comunitatea Bioconductor și au contribuit la creșterea acesteia în ultimii 25 de ani.
Bioconductor la 25 de sărbători.
Comunitate și rețea
Una dintre cele mai puternice teme care au apărut din sondajul BioC2026 a fost valoarea comunității Bioconductor în sine. Participanții au descris conferința ca fiind primitoare, colaborative și interactive și au apreciat oportunitatea de a reconecta cu colegii și de a cunoaște oameni noi. Toți respondenții care au răspuns la întrebare au spus că vor recomanda BioC2026 colegilor lor. Dimensiunea mai mică a conferinței a fost, de asemenea, văzută ca un punct forte. Mai mulți respondenți au remarcat că formatul mai intim a făcut mai ușor să se implice în conversații și să construiască conexiuni în diferite roluri și etape de carieră. Networking-ul a fost în mod constant identificat ca unul dintre cele mai valoroase aspecte ale evenimentului. Participanții au apreciat atât programul științific formal, cât și conversațiile informale care au avut loc în jurul discuțiilor, afișelor și demonstrațiilor. Privind în perspectivă, mulți participanți și-au exprimat interesul pentru și mai mult timp dedicat pentru relații și interacțiune informală.
Infrastructură și instrumente
Zulip
Câștigător al concursului de autocolante
Kayva Vaddadi a fost câștigătoarea concursului de design de stickere BioC2026. Designul Kayva a celebrat Seattle ca oraș gazdă al BioC2026, prezentând repere binecunoscute precum Space Needle, Seattle Great Wheel, Muntele Rainier și pădurile veșnic verzi din jur. Puget Sound și un feribot din statul Washington reflectă peisajul maritim din Seattle și cultura conexiunii din întreaga regiune. Balonul cu aer cald BioC2026 de pe autocolant a fost inspirat de vederile pitorești ale baloanelor populare în zona Seattle și reprezintă spiritul de sărbătoare și de explorare al comunității Bioconductor.
Vezi anunțul aici: https://lnkd.in/p/emAWMGX
Materiale conferinte
Toate înregistrările conferinței sunt disponibile pe canalul YouTube Bioconductor. Atelierele BioC2026 vor fi, de asemenea, disponibile în secțiunea „Arhivată” a workshop.bioconductor.org, alături de atelierele de la evenimentele anterioare BioC, EuroBioC și BiocAsia. Dacă doriți să adăugați materiale suplimentare sau să utilizați platforma pentru propriul atelier sau curs, contactați-ne la support.bioconductor.org.
Evenimente post-conferință
Orchestrarea analizei pe o singură celulă la scară largă cu bioconductor
În perioada 13-14 august, participanții au luat parte la un atelier de tâmplărie axat pe orchestrarea analizei unicelulare la scară largă cu Bioconductor condus de Ted Laderas și Wes Wilson. La atelier au participat 11 participanți și a oferit participanților un mediu practic pentru a lucra prin abordări de analiză a setului de date cu o singură celulă la scară largă folosind instrumente și fluxuri de lucru Bioconductor. Feedback-ul a evidențiat valoarea codării live, a formatului pentru grupuri mici și a abordărilor complementare de predare.
Participanții la atelierul scRNA-seq.
Bioconductor America de Nord 2026 Hackathon
Bioconductor North America 2026 Hackathon a avut loc în perioada 13-14 august, reunind membrii comunității pentru a colabora la proiecte de software și infrastructură care întăresc interoperabilitatea, dezvoltarea software-ului și ecosistemul Bioconductor mai larg. Aceste proiecte au inclus: instrumente de valorificare a inteligenței artificiale pentru standardizarea modului în care utilizatorii din cadrul organizațiilor ar interacționa cu agenții în cadrul proiectelor partajate și asupra resurselor instituționale partajate. Link: https://github.com/eisenefaust/harness_agent
Instrumente bioconductoare pentru includerea componentelor executabile CLI în pachetele Bioconductor. Link: https://blog.bioconductor.org/posts/2026-08-21-biocjobs/
O explorare a analizei comparative a LLM a generat fluxuri de lucru, construind infrastructura și paradigme pentru modul în care putem evalua ceea ce LLM-urile returnează ca produs de lucru la întrebările științifice. Link: https://github.com/Amisor/LLM_BioBenchmarking/tree/main
Participanți la Hackathon.
Mai departe…
Mai târziu în acest an, comunitatea Bioconductor va merge la Melbourne, Australia, pentru BioCAsia2026, care va avea loc în perioada 19-20 noiembrie 2026. BioCAsia2026 reunește cercetători, dezvoltatori și oameni de știință din întreaga regiune Asia-Pacific și nu numai pentru a împărtăși progresele în bioinformatică, biologie computațională și software open-source. Întâlnirea va evidenția instruirea practică, construirea comunității și cele mai recente evoluții în R și Bioconductor. BioC2027 va avea loc apoi la începutul verii în Boston, Massachusetts, continuând seria de conferințe North American Bioconductor și reunind din nou comunitatea pentru schimb științific, colaborare și construirea comunității. Ulterior, comunitatea se va reuni la Basel, Elveția, pentru EuroBioC2027, care va avea loc în perioada 8-10 septembrie 2027. Conferința Europeană a Bioconductorilor va continua să reunească cercetători, dezvoltatori și educatori din întreaga Europă și nu numai pentru a împărtăși noi software, metode și aplicații în biologia computațională.
Mulțumiri
BioC2026 recunoaște cu recunoștință sprijinul tuturor sponsorilor și partenerilor ale căror contribuții și sprijin au făcut posibilă conferința.
Comitetul de organizare
Mulțumim organizatorilor locali, comitetului de program, instructorilor de atelier, vorbitorilor principali, voluntarilor, sponsorilor și tuturor participanților ale căror contribuții au făcut ca BioC2026 să fie un succes.
- Marc Carlson, Spitalul de copii din Seattle
- Nicholas Cooley, Universitatea din Limerick
- Sean Davis, Centrul de Cancer al Universității din Colorado
- Maria Doyle, Universitatea din Limerick
- Mihail Dozmorov, Universitatea Virginia Commonwealth
- Jenny Drnevich, Universitatea din Illinois din Urbana-Champaign
- Russell Eberts, Centrul de Cancer Fred Hutchinson
- Erica Feick, Dana-Farber Cancer Institute
- Sana Hirata, Centrul de Cancer Fred Hutchinson
- Ted Laderas, Centrul de Cancer Fred Hutchinson
- Alexandru Mahmoud, Universitatea din Limerick
- Matthew McCall, Centrul Medical al Universității din Rochester
- Lori (ciobanul) Kern, Roswell Park Comprehensive Cancer Center
- Laurah Nyasita Ondari, Institutul Internațional de Agricultură Tropicală (IITA)
- Charlotte Soneson, Institutul Friedrich Miescher pentru Cercetări Biomedicale
- Tim Triche, Institutul Van Andel
- Levi Waldron, CUNY Graduate School of Public Health and Health Policy
- Wes Wilson, Princess Margaret Cancer Center
